졸업하고 소속이 기능성분자계연구소로 바뀌면서 더이상 학과에서 보내주던 세미나 공지 메일이 날아오지 않아 세미나 관련 정보를 정리해 보았다.

먼저 구글에 들어가서 피드를 등록하기 위해서 구글리더를 찾는데
어라? 메뉴가 안보이네????
찾아보니 구글리더가  7월 1일부로 문을 닫는단다....
구글리더가 망하다니 이게 무슨 소리냐 ㅠ
차선책으로 이것저것 찾아보다 앱으로도 나와 있는 feedly로 갈아타기로 했다.

RSS reader : feedly 


그리고 물리과만 자체적으로 피드를 지원하지 다른과 홈페이지나 ATCTP 같은 경우에도 피드를 지원하지 않았다.
수동으로 RSS를 만들어줘야 하는데 (고난의 시작이였음....) 더이상의 자세한 설명은 생략한다.
(이러고 나중에 후회하겠지....) 
이 과정에 사용한 Feedity 는 피드를 만들면서 광고를 집어 넣는데, 이게 보기 싫어서 pipes를 이용해서 광고를 지우고 날짜순으로 정리하게끔 만들어 보았다.
String 수정 과정을 거쳐서 좀 더 보기 좋은 폼으로 바꾸어야하는데... pipes도 문닫는 소문이 들려서 의욕상실... 


RSS link related to condensed matter physics seminar 
(RSS를 지원하지 않는 곳은 feedity로 rss를 만들었다. 무료계정이라서 광고가 붙어나온다...)

물리학과  : http://thome.postech.ac.kr/RSS/ph/13.xml
화학과 :  http://feedity.com/postech-ac-kr/VlJQUFdT.rss
APCTP :  http://feedity.com/apctp-org/VlJQUFBW.rss

pipes를 이용하여 정리한 통합 RSS 주소 : http://pipes.yahoo.com/pipes/pipe.run? ··· er%3Drss



참고 : RSS feed 만들기

1. How to Create an RSS Feed
2. Make RSS Feeds
3. Pipes
4. Feed validator
5. Feedity

그래핀으로 논리전자소자를 만들기 힘들다는게 여러 실험적인 결과와 이론적인 내용이 말해주고 있다.
먼저 단일층 그래핀으로는 밴드갭을 열기도 힘들 뿐더러, 열린다고 하여도 그 모빌리티가 떨어지기 때문이다.
결과적으로 논리소자로서 가장 중요한 스위치 on/off 상태를 조절하기가 힘들고 실리콘 소자보다 더 좋은 성능을 발휘하기 힘들게 된다.
물론 그래핀이 가진 굉장히 얇은 특성 때문에 여전히 그 가능성은 열려 있지만... 돌파구가 필요한 상태이다.
그에 대한 한가지 대안으로 복층그래핀으로 밴드갭을 조절하는 기술들이 많이 제안되었지만 이 역시 실험적으로 만들기가 쉽지 않기 때문에 소자로서 구현되기는 힘들어 보인다.
예를 들어서 10nm에 하나의 격자가 틀어지기만 해도 AA-AB 결합구조가 복합적으로 존재하는 구조가 만들어져서 밴드갭이 있는 부분과 없는 부분이 공존하기 때문이다. [1]

그래서 앞으로는 그래핀을 이용한 반도체 소자로는 RF 소자나 전극 소자로서 응용될 소지가 더 많을 것으로 기대된다.
예를 들어서 NFC 소자나 플렉서블 디스플레이에서 투명전극소자로서 이용될 가능성이 많고 그러한 연구가 기업이나 연구소에서도 활발히 이루어지고 있는걸로 보인다. [2]

그리고 이건 별개로 그래핀 이어폰도 개발 중이라고 한다.... (생각치도 못했다....;) [3]

[1] http://www.nature.com/nnano/journal/v5 ··· .89.html
[2] http://www.theregister.co.uk/2013/03/0 ··· tenna%2F
[3] http://www.theverge.com/2013/3/14/4103 ··· research

For hybrid functionals and Hartree-Fock, the band structure can be calculated by adding additional k-points with zero weight to the KPOINTS file. This is easily achieved, by performing first a standard hybrid functional calculation with a conventional KPOINTS file. After the run, copy the IBZKPT file to the KPOINTS file (this file stores explictly the list of k-points used in the previous calculation), and simply add the desired additional k-points with zero weight. Since VASP uses an iterative matrix diagonalization and since the added k-points do not influence the energy, one needs to force VASP to perform at least 5 iterations before inspecting the one-electron energies at k-points with zero weight (NELMIN = 5).



Band structures using hybrid functionals have to be calculated the following way:
-) First perform a selfconsistent Hartree-Fock/HSE calculation using a conventional KPOINTS file.
-) Copy the IBZKPT file to KPOINTS, and explicitely add all desired k-points along high-symmetry lines of the BZ that are needed for the bandstructure plot. Add the points at the end of the KPOINTS file, but set the weights of these added k-points to 0.
-) Do not forget to set the number of k-points in KPOINTS correctly (to the number of the k-points used in the standard mesh PLUS the number of the k-points along the lines), such that all k-points are used for the calculations.
-) NKRED can not be used.
-) Perform a second VASP run:
It is recommended to use the Davidson algorithm, since it converges that eigen energies at the new k-points fastest. Since VASP terminates when the total energy is converged to a certain threshold, it is important to force VASP to do a minimum number of steps, so that the orbitals at the new k-points are fully converged (note: since their weight is zero, they do not contribute to the total energy).
This can be done using e.g.

ALGO = N ; NELMIN = 5 ! Davidson, minimum 5 scf-steps
IBRION = 1 ! Use simple charge mixer, since
Pulay might blow up

-) The KS-eigenvalues of the states along the high-symmetry lines are written in OUTCAR, EIGENVAL, vasprun.xml; please cut the k-points required for the bandstructure from one of these files and proceed as usual (using p4vasp or any other graphics tool you usually use to produce bandstructure-plots)

Note: A Hartee-Fock calculation can NOT be continued from an existing CHGCAR file, since the non-local exchange is not determined by the charge density but by the density matrix and/or the KS-orbitals.



Reference:
http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp/vasp/ ··· ons.html 
http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp-forum ··· .6633.10 

다이슨사가 국내 기업에게 소송걸었다는 기사보고 동작 원리를 찾아보니 상당히 인상적이다... 저렇게 베르누이의 원리를 사용할 줄이야. 멋지군!!

[참고자료]
1. Dyson Fan Review (Air multiplier)
2. Air-Multiplier by Dyson.. and the secrets behind the wizardry 

FHI-AIMS 컴파일 도중에

MKL 11.1 로 하니 안되고 10.1 로 하니까 된다.... (여튼 된다.....)
개발자로부터 들어보니 최신 버전으로 하면 또 된다고 하는군...
하지만 아직 Tachyon2에 설치가

또다른 문제는 SCALAPACK, BLACS 링크할때 발생 했는데 그 타계책이
http://icl.cs.utk.edu/lapack-forum/viewtopic.php?t=170

아니 뭐 이런 거지같은 경우가....
믿기 힘들지만 아래처럼 하니까 진짜 된다 (정말 된다)...

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/opt/lib/blacs_MPI-LINUX-0.a
/opt/lib/blacsCinit_MPI-LINUX-0.a
/opt/lib/blacsF77init_MPI-LINUX-0.a
and once again
/opt/lib/blacs_MPI-LINUX-0.a



.
.
.
.
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http://www.xcrysden.org/doc/custom.html

Description of ~/.xcrysden/custom-definitions file

이 파일을 수정하여 취향에 맞게끔 XCrySDen을 수정할 수 있다. (홈 디렉토리에 숨겨져 있다.)


원자색 (100번째 줄)
100번째 줄로 가면 (:100) 원자색을 지정하는 옵션들을 볼 수 있다.
XCrySDen 창을 하나 연 다음에 맘에 안드는 원자색들의 RGB 설정값을 바꿔주자.

ex ) set atmCol (6) {0.95 0.95 0.95}




모자익 (116번째 줄 - 수정전)
좀더 내려가면 tessellation option 도 수정해주자. 35 정도로 올려주면 좀더 쌔매끈한 원자로 그려준다.

## tesselation factor
set myParam(TESSELLATION)    35.0




크리스탈 프레임 (159)
이것도 역시 누리끼리한 색이 맘에 안든다면 슥삭슥삭 바꿔주자.

## RGB color of crystal frame (each compoenent must be within [0,1])
set myParam(FRAMECOL)        {1.00 1.00 1.00}




바탕화면색 (170)
검정바탕으로 그려 토너종결자로 낙인 찍히기 싫다면 역시 수정해주자.


## RGB background of XCRYSDEN display window
## (each compoenent must be within [0,1])
set myParam(BACKGROUND)      {1.00 1.00 1.00}

Single layer graphene (SLG) (pos 에 해당한다) 로부터 Bilayer graphene (BLG) 구조를 만드는 쉘 스크립트.
Selective Dynamics 모드로 만들게 되있는데 필요하지 않다면 뭐 그 부분만 지워주면 된다.

쉘 스크립트는 너무 편해!

#!/bin/bash
s1=`sed -n '9p' pos |awk '{print $1}'`
s2=`sed -n '9p' pos |awk '{print $2}'`
sed -n '1p' pos > POSCAR
sed -n '2p' pos| awk '{printf "%10.6f  \n", $1}'  >> POSCAR
sed -n '3,5p' pos| awk '{printf "%10.6f  %10.6f  %10.6f  \n",$1,$2,$3}'  >> POSCAR
sed -n '6p' pos |awk '{print $1*2}' >> POSCAR
echo "Selective Dynamics" >> POSCAR
sed -n '7p' pos >> POSCAR
sed -n '8,$p' pos| awk '{printf "%10.6f  %10.6f  %10.6f  %10s \n", $1,$2,$3+4.35,"  F  F  F"}' >> POSCAR
sed -n '8,$p' pos| awk -v s1="$s1" -v s2="$s2" '{printf "%10.6f  %10.6f  %10.6f  %10s \n", $1+s1,$2+s2,$3+1,"  F  F  F"}' >> POSCAR

10월 4일 학교 하늘에서 보인 빛기둥들. 결론은 오징어 잡이 어선들의 불빛이 light pillar 현상에 의해서 사진처럼 보인듯 하다.

 

 

Light Pillars (대기중의 얼음입자에 반사된 빛이 나노로드(막대기) 처럼 보이는 현상.)

http://www.islandnet.com/~see/weather/eyes/pillars.htm (원리)
http://www.kuriositas.com/2011/08/ligh ··· ial.html (사진)

 

신기루 (공기의 밀도에 따른 빛의 굴절 현상, 빛은 항상 최단경로를 찾아서 이동한다!)

http://mintaka.sdsu.edu/GF/mirages/mirintro.html
http://virtual.finland.fi/public/default.aspx?contentid=160069&contentlan=2&culture=en-US

 

 

Calculate vacuum level from VLINE ( output file of 'vtot') and DOSCAR.


#!/bin/bash
vac=`awk '{printf "%10.6f\n", $2}' VLINE |sort -g |tail -n 2 |sed -n '1p'`
fermi=`sed -n '6p' DOSCAR|awk '{printf "%10.6f\n",$4}'`
echo "Vaccum level="$vac    
echo "Fermi level="$fermi
echo "scale=4; $vac-$fermi"|bc -l

참 쉽죠?

수소결합 때문에 발생하는 현상이라면 기름물방울에 대해서도 동일한 실험을하여 비교해보면 좋았을거 같은데.. 원본을 찾아봐야겠다.